Besonders auf den freien Fließstrecken ist das Wissen über die Beschaffenheit und die Form der Stromsohle Voraussetzung für die sichere Befahrung der Donau. Die Bereiche Hydrographie und Hydrologie erfassen in regelmäßigen Abständen bzw. während und nach Extremereignissen Daten – zum Beispiel im Rahmen von aufwändigen Hochwassereinsätzen – werten diese aus und leiten gegebenenfalls entsprechende bauliche Maßnahmen ein. Daneben bilden die gemessenen Daten auch die Grundlage für die Erstellung der digitalen Binnenschifffahrtskarte (Inland ECDIS).

Mit drei mobilen Messwägen und drei Messschiffen verfügt das Messwesen von via donau über eine gerätetechnische Ausstattung auf höchstem technischem Standard. Haupteinsatzgebiete.sind die Donau, March und Thaya. 

Ein Aufgabenschwerpunkt sind Sohlgrundaufnahmen sowie Durchfluss- und Strömungsmessungen. Die Sohlen von fließenden und ruhenden Gewässern werden standardmäßig mit Singlebeam-Vermessungsecholoten erfasst, für Spezialaufgaben steht ein Flachwasser-Flächenecholot zur Verfügung. Durch ADCP-Ultraschall-Technik (Acoustic Doppler Current Profiler) werden Strömungsmessungen, Durchflussermittlungen und auch Tiefenbestimmungen unter Nutzung des Doppler-Effektes von Brücken oder von Schiffen aus durchgeführt.

Schwebstoffmessungen und das gesamte Pegelwesen gehören ebenso zum Aufgabenbereich von via donau wie Vermessungsaufgaben an Land, Lage- und Höhenaufnahmen, Setzungs- und Neigungsmessungen, Kontrollnivellements, Vermessung von Wasserbauwerken u.v.m.

Aufgrund langjähriger Erfahrung im Hochwassereinsatz obliegt dem Team auch die Leitung des Hochwasserdienstes.

Alle Kartengrundlagen werden EDV technisch verarbeitet, gewartet und archiviert und münden in einem umfassenden Geo-Informationssystem, wo die Verknüpfung mit anderen Informationsebenen möglich ist.